南通市肿瘤医院妇瘤科建于1973年。目前是集临床、教学及科研为一体的南通市临床重点学科和重点专科。2015年起成为国家宫颈癌早诊早治的最早联盟单位。科室拥有医师团队28人，其中高级职称16人，硕导3人，博士1人，在读博士3人，硕士12人，省“333工程”人才培养3人，市“226工程”培养人才4人，市医学重点人才4人。

作为南通市唯一的肿瘤专科，科室收治南通地区60%以上的妇科恶性肿瘤患者，覆盖盐城、扬州、张家港、安徽及新疆等多个城市，拥有一支强大的妇科肿瘤诊治团队，严格遵循诊疗规范化、个体化和精准化的原则，自2019年起成立妇瘤MDT团队，技术力量进一步提高，省内乃至全国享有盛名，2022年和2023年分别获第一批国家癌症中心卵巢癌和宫颈癌规范化诊疗质控试点单位。科室南北院共设三大病区，开放床位133张，另外还设有日间妇科放疗病区，每年收治妇科恶性肿瘤5000余人次。以收治宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌、外阴癌等妇科恶性肿瘤为主，开展宫颈癌及子宫内膜癌的规范化根治手术、卵巢癌肿瘤细胞减灭术及联合脏器切除术、外阴广泛切除术加（或）腹股沟淋巴结清扫术、复发性、难治性妇科恶性肿瘤的规范化治疗等10多个重点专科项目，Ⅳ级以上手术占近70%。

作为宫颈癌根治性放疗不可缺少的近距离放射治疗技术是科室的另一个重点项目，科室每年收治宫颈癌放射治疗患者400余例。覆盖几乎整个南通地区的宫颈癌放疗患者，通过体外放疗与近距离相结合治疗模式，晚期患者5年治愈率近75%。为了满足临床需求和学科发展，2020年配制三维近距离放射治疗机，2022年妇科成立妇放亚专科团队，与国际接轨，开展三维后装治疗及三维插植技术，精准化的治疗进一步减少放疗副反应，提高疗效，为整个南通地区宫颈癌的诊治作出较大贡献。