南通市肿瘤医院胃肠外科创建于1974年，现为南通市医学重点学科。科室现有主任医师5人，副主任医师7人，主治医师6人，住院医师3人；其中博士4人，硕士14人，南通市“226高层次人才培养工程”培养对象2人，南通市青年医学重点人才2人。

科内多人担任省、市级协会主任委员、副主任委员，学科带头人为江晓晖主任。科室主要开展胃癌、十二指肠癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤、腹膜后肿瘤、四肢软组织肿瘤、恶性黑色素瘤等疾病的诊疗工作。科室拥有高清腹腔镜4台，3D腹腔镜1台，常规开展腹腔镜胃癌根治术、腹腔镜结直肠癌根治术（包括腹腔镜直肠癌根治术及侧方淋巴结清扫术、腹腔镜根治性右半结肠切除术、腹腔镜根治性左半结肠切除术、腹腔镜乙状结肠癌根治术）、腹腔镜全结肠切除术、腹腔镜小肠肿瘤切除术、腹腔镜下胃间质瘤切除术、胃肠道肿瘤的双镜联合手术、胰十二指肠切除术、各类开放胃肠道手术、各类腹膜后肿瘤切除术、四肢软组织肿瘤切除术及恶性黑色素瘤的综合治疗，开展进展期胃癌、结直肠癌的新辅助化疗，术中化疗，胃肠肿瘤的快速康复技术，超低位直肠癌的保肛手术。

科室参与国家城市癌症早诊早治项目，承担胃癌、结直肠癌的早诊早治工作。科室成立了胃癌多学科诊疗（MDT)团队及结直肠癌多学科诊疗（MDT)团队多年，复杂病例常规经MDT团队讨论，为患者制定合理治疗方案。根据每位病人的机体状况、肿瘤的病理类型、侵犯范围和发展趋向，实施肿瘤的“个体化”治疗，合理地、有计划地应用各种治疗手段，以期较大幅度地提高和改善病人的生活质量。科室联合肿瘤内科、放疗科、肝胆外科、内镜中心、影像科、麻醉科、病理科等多学科专家，组成专家团队，定期为患者召开MDT病历讨论，从病理诊断、影像学特征、临床现状及家族史、外科手术指征、放化疗的利弊等方面作全面的评估，在此基础上达成治疗共识，为患者提供“一站式”服务。